カスタマイズは子テーマで行うべきですか？

見た目（CSS・レイアウト）の調整や、テーマ側のテンプレートを書き換える系のカスタマイズは、子テーマで行っていただくのがおすすめです。テーマを直接書き換えると、テーマがアップデートされたときに変更が消えてしまうため、子テーマで分けておくと安全です。プラグイン本体の機能を変えるカスタマイズについては、独自プラグインを作るかフックを使う形が安全です。